Nanotube Modeler是一款能够轻松进行碳纳米管绘图的软件。碳纳米管画图设计人员必备的Nanotube Modeler。该软件旨在帮助用户以简单的方式生成纳米管和纳米锥的xyz坐标,并支持许多不同的视图类型,例如切换原子,切换键,切换投影,线框模型和空间填充模型。此外,我们还为您提供丰富的工具,例如MOL查看器,PDB查看器,CIF查看器,VRML查看器,启动POV-Ray,XY工作表生成器,半径计算器,纳米孔阵列,多层石墨烯。提供完美的碳纳米管绘图解决方案,朋友谁需要它快速下载!
安装方式:
1.下载并解压缩该软件,双击安装程序以进入Nanotube Modeler安装向导,然后单击[下一步]。
2.选择安装位置。用户可以选择默认的C:\ Program Files \ NanoTube或对其进行自定义。
3.正在安装Nanotube Modeler,用户等待安装完成。
4.弹出以下成功安装Nanotube Modeler的提示,单击[完成]结束。
软件特色:
Nanotube Modeler是一款高级软件应用程序,旨在帮助您生成纳米管和纳米锥的x,y和z坐标,并使用集成的查看器或您选择的外部程序对其进行分析。
此外,该工具可以使用交互式图形来创建布基球和石墨烯片。
用户界面
GUI在主窗口中显示当前对象的结构。您可以使用鼠标拖动动作从不同角度可视化对象。
工具该工具允许您选择对象类型,即纳米管,纳那酮,石墨烯片,锥片,布基球。此外,您可以访问Fullerene库(CC1或XYZ文件格式)或启用病毒几何模式。
查看选项,管变形和原子坐标
使用Nanotube Modeler,您可以在工作环境中隐藏或显示原子和键,调整原子和键的大小,围绕x,y或z轴旋转对象,并以几种立体模式(平行,十字眼或浮雕) 。
应用该应用程序支持管变形,并允许您在主面板中预览带有原子坐标的列表。您可以从Fullerene,XMOL,XY或IMM PDB数据导入结构,将结构导出为MOL,XMOL,PDB,CIF,VRML,PDF或MLM文件格式,然后将图像和XYZ表复制到剪贴板。
特殊查看器可用于分析MOL,PDB,CIF,VRML和POV结构,或者您可以配置用户定义的结构。您可以更改背景,原子和键的颜色。
考虑到所有因素,Nanotube Modeler集成了各种强大的功能,可帮助您生成纳米管或其他物体的坐标。
使用说明:
工具栏
将XYZ坐标另存为* .txt文件
将XYZ坐标复制到剪贴板
重新计算几何(也请输入)
自动绕屏幕水平轴自动旋转(右键单击可前进90度)
自动绕垂直屏幕轴自动旋转(单击鼠标右键可前进90度)
自动绕屏幕法线轴自动旋转(单击鼠标右键可前进90度)
重置缩放和方向
隐藏/显示控制面板
切换透视图/正交投影
立体声模式(立体声对,立体声视图)
插入的圆柱体/球的切换阴影(用于管和布基球)
切换Atom可见性
y开/关
设置原子半径系数(同时单击状态栏面板2左/右)
打开/关闭按键可见性
设置键宽度因子(也单击状态栏面板4的左/右)
热键
输入:重新计算几何
向上/向下箭头键:围绕屏幕的水平轴旋转
左右箭头键:围绕垂直屏幕轴旋转
Shift +方向键:绕屏幕法线轴旋转
Ctrl +方向键:绕上述轴前进90度
加/减键:放大/缩小
空格键:重设缩放和方向
鼠标使用
双击显示区域:重置缩放和方向
左鼠标左键拖动:围绕水平和垂直屏幕轴旋转
优点拖动显示区域左侧的鼠标右键:绕屏幕法线轴旋转
优先将鼠标右键拖动到显示区域的右侧:放大/缩小
XY生成器工具
工具此工具用于通过从图像提取XY绘图坐标集或手动组装原子阵列来创建XY绘图坐标集。在这两种情况下,您都可以通过单击所需位置来删除或添加单个原子。可以从菜单[Tools] [XY-Sheet Generator]启动工具窗口。保存XY坐标集后,您可以从主窗口菜单[文件] [导入XY数据]加载创建的数据文件。由于XY坐标是在屏幕坐标系中创建的,因此它们以像素为单位保存。将XY文件加载到主窗口中时,将根据主窗口中键合长度的输入值重新解释和缩放坐标。
1.从图像中提取XY坐标
图像此处使用的图像在子文件夹“ \ lib”(sample_XYimport.gif)中。
清除XY数据或选择原子阵列
打开图像文件(GIF,JPG,BMP)
半径图像中原子的近似半径[像素]
执行Huff变换以进行原子搜索
重绘当前XY数据
将XY数据另存为(* .xy)文件
单击显示区域以添加/删除原子
执行霍夫变换搜索后,应找到大多数原子。如果不是,请修改原子半径的值,然后再次运行搜索。如果仍然缺少原子,则可以通过单击所需位置来添加原子。如果发现太多或重叠的原子,则可以通过右键单击来删除错误的原子。
2.手动组装XY坐标
首先单击“新建”按钮以选择要创建的原子阵列的类型。
使用当前显示在主窗口中的管/圆锥中的工程图数据
创建一个蜂窝阵列
创建一个正方形数组
此处创建了大约20 x 20 A的石墨烯片。单个原子已被删除。您也可以拖动原子,但是原子碰撞运动仍需要改进。
纳米孔阵列发生器
rh金属幕上的纳米孔阵列已被用作聚焦光的透镜。该工具从准周期图块的顶点创建一组XY坐标。将对偶方法应用于多网格以生成准周期图块,该图的顶点用作可能的纳米孔阵列的xy位置。
1.用户界面
单击#5按钮以计算新切片。如果图块中有间隙,请增加“循环顺序”滑块值以生成更多图块/顶点。
查看准周期拼贴(单击与#5相同的图像)
查看孔阵列图像
查看XY表
查看傅立叶变换(单击[-] [+]调整亮度)
重新计算新瓷砖
保存XY坐标文件
将图像复制到剪贴板
软件功能:
交互式图形(通过拖动鼠标旋转结构)
生产纳米管,纳米锥,布基球,石墨烯片
创建带盖的(9,0)和(5,5)管
deformation骨管变形的应用
创建单壁或多壁纳米管(SWNT,MWNT)
导出XYZ,JPG,BMP,PDF,MOL,XMOL,PDB,CIF,VRML,POV文件
导入XY绘图坐标文件(可以卷成管)
展出IMM的Drexler-Merkle分子机器
XY绘图生成工具(图像搜索/手动组装)
纳米管异质结(使用CoNTub插件)
导入XMOL坐标文件(可以将变形应用于纳米管数据)
盖管(6,6),(10,0)和(10,10)
通过翻译单位数创建试管
自定义MWNT输入/半径计算器/ MWNT序列查找器
longer原子增加,用于更长的管
虹彩图案
用于ICSD样式原子数据块的新CIF输出选项
用户导出MOL文件的指定债券定单
修改为欧洲客户使用(小数点/逗号问题)
选择一或两个盖作为盖管
超长管(> 100,000 A)
导出债券连接文件
导出MLM文件(敏捷元素)
导出纳米孔阵列
导出VRML1.0(VRML2.0除外)
多层石墨烯片
选项多层石墨烯片的旋转选项